氫分子容易隨著空氣溢散，不易保存，完全密閉的存放條件，有利於氫水的保存。
建議存放於不鏽鋼保溫瓶或玻璃瓶中，將氫水裝滿不要殘留空氣、避免搖晃震動，1-2小時內喝完效果最佳。